閱讀:29發布時間:2020/12/21
二代測序(NGS)的建庫流程是很長很復雜的,建庫的每一步都建立在前一步的基礎上,因而質量控制(QC)顯得尤為重要。無論您的初始樣本類型是什么,在整個實驗流程中,確保靶標的完整性、大小和集中程度是構建高質量文庫,進而獲得準確、可重復的結果的關鍵。為了幫助您更好地確定實驗流程,安捷倫匯總了各類初始樣本的各種建庫流程。
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測序過程中的關鍵 QC 步驟
Fragmentation
片段化是將樣本剪切成更小的片段的過程。可以通過酶切或超聲的方法來實現。QC 是這里的一個重要步驟,以確保片段化的條件是合適的。
Ligate adaptors
接頭是已知的寡核苷酸序列,用于連接到未知的目標測序片段,提供測序引物結合區和樣本識別碼。接頭連接后的 QC 可以確保接頭成功連接到 DNA。
Size selection
片段篩選的目的是去掉多余的引物和接頭序列,獲得需要的目標序列。QC 在這一步是至關重要的,可以確保后留下的是目標大小和足夠濃度的文庫。
Normalize/pool
在文庫制備結束時,必須對樣本進行量化,以確定要加載到測序儀上的文庫量。如果需要多個文庫混合上機測序,QC 可以幫助提供稀釋指導,確保加載到測序儀上的文庫是均勻的,有利于提高數據的均一性。
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G2939BA | 2100 生物分析儀 |
5067-1505 | DNA 1000 Reagents |
5067-4626 | High Sensitivity DNA Kit |
G2991AA | 4200 TapeStation 系統 |
G2992AA | 4150 TapeStation 儀器 |
5067-5582 | D1000 ScreenTape |
5067-5583 | D1000 Reagents |
5067-5586 | D1000 Ladder |
5067-5584 | High Sensitivity D1000 ScreenTape |
5067-5585 | High Sensitivity D1000 Reagents |
5067-5587 | High Sensitivity D1000 Ladder |
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