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      ThruPLEX Plasma-seq Kit,血漿cfDNA文庫

      簡要描述:ThruPLEX Plasma-seq Kit,血漿cfDNA文庫構建試劑優化了模版修復和文庫合成步驟,用于血漿游離DNA(cell-free,cfDNA)的illumina文庫構建。適用腫瘤(ctDNA循環腫瘤DNA)及產前無創檢測(母體血漿中胎兒游離DNA分析)所需WGS、WES和靶向測序。

      • 產品型號:Rubicon R400491
      • 廠商性質:生產廠家
      • 更新時間:2019-03-29
      • 訪  問  量:2106
      詳細介紹
      品牌其他品牌貨號R400490/R400491/R400492
      規格12/48/96次反應供貨周期一個月
      主要用途cfDNA illumina文庫,腫瘤及產前無創檢測(母體血漿中胎兒游離DNA)

      華雅旗下紅榮微再授權代理TAKARA Rubicon 文庫構建(illumina平臺)產品

       

       

      Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit

      ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

      產品英文名稱:ThruPLEX® Plasma-seq Kit

      產品中文名稱:血漿來源cell free DNA NGS文庫構建試劑

      樣本:血漿來源的cfDNA(cell free DNA)和ctDNA(循環腫瘤DNA)

      用途:WGS,WES,靶向測序,ctDNA分析

       

      ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫(illumina平臺)構建。

      該試劑專門針對cell-free DNA進行優化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。

      血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液體活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

       

      產品特點

      專為cfDNA設計:修復及連接試劑配方更新,方法優化

      高品質NGS文庫:在寬廣的GC含量范圍內,可以達到高檢測再現性

      起始量范圍廣:<1 ng30 ng cfDNA

      快速簡便:單管、2小時、3步操作步驟,無需純化或樣品轉移步驟

      應用領域:液體活檢、ctDNA、靶向測序等領域文庫構建

      兼容自動化平臺:Beckman® FXP Workstation

       

      ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

      Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols

      High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage

      Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA

      Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps

      Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing

      Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation

       

      產品應用

      WGS,WES,靶向測序,ctDNA分析

      cfDNA文庫構建,腫瘤及產前無創檢測(母體血漿中胎兒游離DNA分析)

      ThruPLEX Plasma-seq 優化用于cell-free DNA等液體活檢樣品

      液體活檢樣品包括

      循環核酸

      – Cell-free DNA (cfDNA)

      • 循環腫瘤DNA(ctDNA)占一小部分

      及RNA 外泌體等

       

      ThruPLEX技術原理

      ThruPLEX技術和所有Illumina NGS平臺兼容。

      技術要點:莖環形接頭

      莖環形接頭的特別設計,免去了大多數Illumina等文庫制備技術需要的中間純化和樣品轉移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應管、2個小時、3步反應的簡單過程。僅在PCR反應后進行1次磁珠純化,純化造成的樣品損失低,可對珍貴樣品進行有效分析。

       

      產品使用

      適用樣本:液體活檢樣本

      1ng-30ng 血漿、尿液來源的cfDNA

       

      組份 

      分模板準備、文庫合成和文庫擴增三大部分。保存-20℃。

      Template Preparation Buffer 模板準備緩沖液(紅色)

      Template Preparation Enzyme 模板準備酶(紅色)

      Library Synthesis Buffer文庫合成緩沖液(黃色)

      Library Synthesis Enzyme文庫合成酶(黃色)

      Library Amplification Buffer文庫擴增緩沖液(綠色)

      Library Amplification Enzyme文庫擴增酶(綠色)

      Nuclease-Free water 無核酸酶水(無色)

      Indexing 試劑(藍色)

      咨詢 1500 1904 520 紅榮微再-客服: 經銷商專員

      自備材料:

      PCR管或96PCR板和密封件

      Low binding aerosol barrier tips

      新鮮制備的80%(v / v)乙醇

      Agencourt® AMPure® XP 磁珠Beckman Coulter,目錄號A63880

       

      可選試劑:

      KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)

      EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)

      Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories

       

      簡單的工作流程:一管反應

       

      樣品加入PCR管。

      準備模版修復混合液1(紅蓋),加入PCR管,反應。

      準備文庫合成混合液2(黃蓋),加入PCR管,反應。

      準備文庫擴增混合液3(綠蓋),加入PCR管,反應。

       

      產品性能

       

      cell-free DNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicatesunmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序,且每個文庫產生17 M25 M reads。每個文庫在down-sampling數據至17 M reads以后,計算Duplication rates

       

      Rubicon R400490/R400491/R400492 訂購信息

       

      貨號

      名稱

      規格

      價格

      R400490

      ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

      12 Rxns

      ¥9109

      R400491

      ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit

      48 Rxns

      ¥31533

      R400492

      ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit

      96 Rxns

      ¥56760

       

      Rubicon公司成立于2000年,總部位于美國密歇根州。產品都擁有技術,檢控嚴格,擁有cGMP級生產能力,是單細胞測序文庫構建的。2017年1月,Rubicon 成為Takara的一員,并且發展良好。

      華雅再生醫學旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司主營細胞治療和精準醫療等產品,2018年與TAKARA繼續合作,授權代理(上海)其旗下Rubicon單細胞文庫構建試劑等產品。

       

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