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Rubicon血漿游離DNA測序試劑盒 RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit
Rubicon Genomics成立于2000年,總部位于美國密歇根州。該公司的核心競爭力產品包括酶學、核酸化學、樣品的加工生產,該公司致力于創新、知識產權的發展和持續的產品開發。
Rubicon Genomics開發創新、高品質的、核酸文庫的制備及配套產品,血漿游離DNA基因測序試劑盒能夠對臨床樣本進行簡單、快速可靠和高靈敏度的分析。
■ 產品說明:
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。
該試劑專門針對cfDNA進行優化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液態活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、無創產前基因檢測、腫瘤無創檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。
紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司主營:干細胞、精準醫療、細胞治療、器官再生 四大板塊的產品,以“傳遞科學價值,服務科學研究”為宗旨,經過近兩年的努力推廣,紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司在全中國代理的Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒產品已經成功銷往:上海市、北京市、重慶市、天津市、廣東省的廣州市、深圳市、珠海市、江西省的南昌市、四川省的成都市、綿陽、浙江省的杭州市、寧波、溫州、江蘇省的南京市、蘇州、無錫、泰州、湖南省的長沙、陜西省的西安市、楊凌、甘肅省的蘭州、寧夏的銀川、新疆的烏魯木齊、廣西的南寧市、山東省的濟南、青島、東北三省 遼寧省的沈陽市、大連市、吉林省的長春市、黑龍江省的哈爾濱市等中國絕大部分省市和自治區。Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、無創產前基因檢測、腫瘤無創檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。
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產品組成
· Template Preparation Buffer(Red)模板準備緩沖液(紅色)
· Template Preparation Enzyme(Red)模板準備酶(紅色)
· Library Synthesis Buffer(Yellow)文庫合成緩沖液(黃色)
· Library Synthesis Enzyme(Yellow)文庫合成酶(黃色)
· Library Amplification Buffer(Green)文庫擴增緩沖液(綠色)
· Library Amplification Enzyme(Green)文庫擴增酶(綠色)
· Nuclease-Free Water(Clear)無核酸酶水
· Indexing Reagent(Blue)or Indexing Plate索引試劑(藍色)
· Quick Protocol(N/A)使用方法
■ 保存
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Code No. | Takara No. | 產品名稱 |
R400490 | RB4490 | ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit |
R400491 | RB4491 | ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit |
R400492 | RB4492 | ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit |
高品質血漿來源cell free DNA NGS文庫構建試劑
ThruPLEX® Plasma-seq Kit
紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司主營:干細胞、精準醫療、細胞治療、器官再生 四大板塊的產品,以“傳遞科學價值,服務科學研究”為宗旨,經過近兩年的努力推廣,紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司在全中國代理的Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒產品已經成功銷往:上海市、北京市、重慶市、天津市、廣東省的廣州市、深圳市、珠海市、江西省的南昌市、四川省的成都市、綿陽、浙江省的杭州市、寧波、溫州、江蘇省的南京市、蘇州、無錫、泰州、湖南省的長沙、陜西省的西安市、楊凌、甘肅省的蘭州、寧夏的銀川、新疆的烏魯木齊、廣西的南寧市、山東省的濟南、青島、東北三省 遼寧省的沈陽市、大連市、吉林省的長春市、黑龍江省的哈爾濱市等中國絕大部分省市和自治區。Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、無創產前基因檢測、腫瘤無創檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。
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圖1. ThruPLEX® 技術概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技術3步反應即可完成針對cell free DNA的建庫工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進行末端修復。通過采用莖環形接頭(無單鏈尾巴)進行高效平端連接,降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解,進一步降低背景。高保真度擴增的方式完成以上反應,并獲得含有illumina index的文庫。
圖2. 高cfDNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序,且每個文庫產生17 M到25 M reads。每個文庫在down-sampling數據至17 M reads以后,計算Duplication rates。
紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司主營:干細胞、精準醫療、細胞治療、器官再生 四大板塊的產品,以“傳遞科學價值,服務科學研究”為宗旨,經過近兩年的努力推廣,紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司在全中國代理的Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒產品已經成功銷往:上海市、北京市、重慶市、天津市、廣東省的廣州市、深圳市、珠海市、江西省的南昌市、四川省的成都市、綿陽、浙江省的杭州市、寧波、溫州、江蘇省的南京市、蘇州、無錫、泰州、湖南省的長沙、陜西省的西安市、楊凌、甘肅省的蘭州、寧夏的銀川、新疆的烏魯木齊、廣西的南寧市、山東省的濟南、青島、東北三省 遼寧省的沈陽市、大連市、吉林省的長春市、黑龍江省的哈爾濱市等中國絕大部分省市和自治區。Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、無創產前基因檢測、腫瘤無創檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。
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圖3. 優異的靶向測序文庫構建能力。圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫通過panel進行高效捕獲,對kinome進行深度測序分析以檢測突變。3個血漿樣品分別起始建庫量為5 ng、6.5 ng、10 ng,三次重復。目標區域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進行捕獲,并用Illumina Miseq平臺進行測序,平均每個文庫獲得5 M reads,目標堿基被成功捕獲分析。
圖4. 高重復性的、無偏倚的GC覆蓋度。針對人類基因組,ThruPLEX Plasma-seq Kit表現出高再現性、低偏倚GC覆蓋度NGS文庫構建能力。9次獨立的血漿樣品文庫構建的實驗結果表明,ThruPLEX重復性高于其它產品。文庫的制備是利用的1 mL血漿來源cfDNA,后續采用illumina NextSeq 500進行測序。作為對比,NEBNext Ultra構建了4份獨立血漿樣品的文庫。
紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司主營:干細胞、精準醫療、細胞治療、器官再生 四大板塊的產品,以“傳遞科學價值,服務科學研究”為宗旨,經過近兩年的努力推廣,紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司在全中國代理的Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒產品已經成功銷往:上海市、北京市、重慶市、天津市、廣東省的廣州市、深圳市、珠海市、江西省的南昌市、四川省的成都市、綿陽、浙江省的杭州市、寧波、溫州、江蘇省的南京市、蘇州、無錫、泰州、湖南省的長沙、陜西省的西安市、楊凌、甘肅省的蘭州、寧夏的銀川、新疆的烏魯木齊、廣西的南寧市、山東省的濟南、青島、東北三省 遼寧省的沈陽市、大連市、吉林省的長春市、黑龍江省的哈爾濱市等中國絕大部分省市和自治區。Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、無創產前基因檢測、腫瘤無創檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。
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