單細(xì)胞起始的DNA測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建 | ||||||||||||
PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit | ||||||||||||
· 高重現(xiàn)性和準(zhǔn)確性:可用于CNV、SNV和非整倍體檢測(cè) · 在SNV和CNV檢測(cè)方面優(yōu)于MDA技術(shù) · 三小時(shí)的工作流程,手動(dòng)操作時(shí)間不到30分鐘 · 均勻的高覆蓋率,低的等位基因插入率和脫扣率 | ||||||||||||
■ 應(yīng)用: | ||||||||||||
適用于以下細(xì)胞類型的文庫(kù)制備: | ||||||||||||
· 癌癥研究:循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC),激光捕獲顯微切割(LCM)細(xì)胞或DNA, 以及細(xì)針抽吸(FNA)細(xì)胞; · 生殖健康研究:胚胎細(xì)胞和循環(huán)胎兒細(xì)胞; · 發(fā)育生物學(xué):胚胎細(xì)胞,干細(xì)胞和稀有細(xì)胞; · 宏基因組學(xué)和微生物學(xué):微生物細(xì)胞,微生物組和環(huán)境樣品。 | ||||||||||||
■ 產(chǎn)品說(shuō)明: | ||||||||||||
PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit | ||||||||||||
PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一種旨在從單細(xì)胞中生成高質(zhì)量的DNA文庫(kù),以便在Illumina平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序的試劑盒。該試劑盒基于PicoPLEX技術(shù),優(yōu)化用于檢測(cè)拷貝數(shù)變異 (CNVs)、單核苷酸變異 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和結(jié)構(gòu)變異 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV檢測(cè)中表現(xiàn)出比MDA技術(shù)更好的性能。 PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的 Index如下所述,需要單獨(dú)購(gòu)買。 PicoPLEX WGA是一種被廣泛用于檢測(cè)單細(xì)胞中CNV的全基因組擴(kuò)增(WGA)技術(shù)。初,PicoPLEX技術(shù)主要用于高再現(xiàn)性的檢測(cè)非整倍體異倍性和CNV。為了滿足準(zhǔn)確檢測(cè)SNV的需求,對(duì)PicoPLEX WGA技術(shù)中的酶、引物和protocols進(jìn)行了進(jìn)一步優(yōu)化,不僅提升了擴(kuò)增的覆蓋度、一致性、準(zhǔn)確性,同時(shí)提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率,并且保持了高重現(xiàn)性。 PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定細(xì)胞或非固定細(xì)胞起始,只需簡(jiǎn)單的4步操作流程,即可在3小時(shí)內(nèi)完成Illumina NGS文庫(kù)的構(gòu)建,且手動(dòng)操作時(shí)間非常短。 | ||||||||||||
DNA HT dual index kits | ||||||||||||
DNA HT dual index kits是與 ThruPLEX或 PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用,用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列對(duì)應(yīng)的index引物,多可提供384種不同的雙端index,用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。其中index引物預(yù)先分裝在4個(gè)的不同條形碼標(biāo)記的index微孔板中,每個(gè)微孔板可提供不同的96種index組合 (Code No.R400660-R400663),index微孔板(96N Sets A-D)的每個(gè)孔提供的量足夠進(jìn)行一次測(cè)序反應(yīng);另一種是一套中有24個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)管,每個(gè)反應(yīng)管中包含不同的雙端index組合(Code No.R400664),且每個(gè)反應(yīng)管(24N)提供的量足夠進(jìn)行兩次測(cè)序反應(yīng)。 | ||||||||||||
DNA unique dual index kits | ||||||||||||
DNA unique dual index kits是與 ThruPLEX或 PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用,用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對(duì)應(yīng)的index引物,多可提供96種不同雙端index,用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的4組各24個(gè)單獨(dú)的管中,其中每組可提供24種不同index引物組合(Code No.R400665-R400668)。每個(gè)index引物管(24U Sets A-D)提供的量足夠進(jìn)行兩次測(cè)序反應(yīng)。 | ||||||||||||
DNA single index kits | ||||||||||||
DNA single index kits是與 ThruPLEX或 PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用,用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對(duì)應(yīng)的index引物,可提供24種單端index,用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的2組各12個(gè)單獨(dú)的管中,其中每組可提供12種不同index引物組合(Code No.R400695和R400697)。每個(gè)index引物管(12U Sets A-B)提供的量足夠進(jìn)行8次測(cè)序反應(yīng)。 | ||||||||||||
圖1. PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技術(shù)。 PicoPLEX Gold的技術(shù)概要。通過(guò)step1裂解細(xì)胞獲得gDNA,通過(guò)隨機(jī)引物進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增 (step 2),然后進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增得到測(cè)序文庫(kù)(step 4)。 | ||||||||||||
圖2. PicoPLEX Gold的主要特點(diǎn):高覆蓋度,高均勻性,和高重現(xiàn)性 (與A產(chǎn)品技術(shù)相比)。 Panel A. 圖中顯示在不同深度的測(cè)序中覆蓋的堿基數(shù) (~35M read pairs,PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在較低深度的覆蓋度與A產(chǎn)品 (MDA) 相似,在較高深度的覆蓋度高于A產(chǎn)品(MDA)。 Panel B. 以gDNA樣本 (NA12878) 和單細(xì)胞樣本 (GM12878) 起始,使用PicoPLEX Gold和A產(chǎn)品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增。相比較于MDA,PicoPLEX Gold顯示出更均勻的覆蓋度。 Panel C. 評(píng)估覆蓋度的重現(xiàn)性。與A產(chǎn)品 (右) 相比,PicoPLEX Gold (左) 的在兩個(gè)單細(xì)胞群之間的一致性明顯更好。 | ||||||||||||
圖3. 使用PicoPLEX Gold進(jìn)行高質(zhì)量單核苷酸變異(SNV)檢測(cè)。 產(chǎn)品訂購(gòu)信息:
上海華雅思創(chuàng)生物科技有限公司主營(yíng):生物技術(shù)產(chǎn)品的銷售與技術(shù)服務(wù)、生物新技術(shù)新產(chǎn)品展示、生命科學(xué)領(lǐng)域項(xiàng)目合作服務(wù)、品牌策劃與品牌形象廣告宣傳、生物醫(yī)藥行業(yè)人才咨詢服務(wù)、生物醫(yī)藥行業(yè)管理咨詢服務(wù)。以“傳遞科學(xué)價(jià)值,服務(wù)科學(xué)研究”為宗旨,經(jīng)過(guò)近十年的努力,上海華雅思創(chuàng)生物科技有限公司在全中國(guó)代理的干細(xì)胞產(chǎn)品已經(jīng)成功銷往:上海市、北京市、重慶市、天津市、廣東省的廣州市、深圳市、珠海市、江西省的南昌市、四川省的成都市、綿陽(yáng)、浙江省的杭州市、寧波、溫州、江蘇省的南京市、蘇州、無(wú)錫、泰州、湖南省的長(zhǎng)沙、陜西省的西安市、楊凌、甘肅省的蘭州、寧夏的銀川、新疆的烏魯木齊、廣西的南寧市、山東省的濟(jì)南、青島、東北三省 遼寧省的沈陽(yáng)市、大連市、吉林省的長(zhǎng)春市、黑龍江省的哈爾濱市、海南省三亞等中國(guó)絕大部分省市和自治區(qū)。 |
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