REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒操作指南

試劑盒組份

操作方法選擇

根據起始樣本選擇操作方法

其他起始樣本：血漿血清、活檢、需要高通量擴增的樣本等參見其他對應說明書。

操作流程

方法*程

細胞樣本——加入變性混合液——65°C孵育10min——加入終止液——加入Master混合液——30°C孵育8h，65°C 終止3min——獲得擴增DNA

方法二流程

純化基因組DNA——加入變性混合液——15-25°C孵育3min——加入neutralization混合液——加入Master混合液——30°C孵育8h，65°C 終止3min——獲得擴增DNA

需要自備的儀器和試劑

微離心管

水浴或其他加熱儀器

微型離心機

漩渦混合儀（Vortexer）

吸管和吸頭

冰

方法一：從單細胞擴增基因組DNA

實驗開始前注意事項

1.適用樣本：1-1000個完整細胞

這個方法適用于所有物種的單細胞樣本，如：脊椎動物，細菌（革蘭氏陽性菌和陰性菌），植物（細胞壁已脫），分選細胞，組織培養細胞和細胞。

不適用樣本：福爾馬林固定樣本或其他使用交聯劑固定的樣本，如：從福爾馬林固定石蠟包埋組織中激光顯微切割得到的單細胞樣本。

2.小心試劑不要被外源DNA污染。如：使用干凈獨立吸頭吸管，在無DNA地方進行反應操作。

3.純化基因組DNA擴增參見方法二。

4.聚合酶要在冰上解凍（見步驟6）。其他成分可以室溫解凍（15–25°C）。

5.配制的D2緩沖液（變性緩沖液）存放不要超過3個月。

6.陰性對照（無模板）的DNA產量約 40 µg。因為REPLI-g 的單細胞擴增反應中，引物二聚體的隨機擴增得到高分子量的DNA產物。這一DNA不會影響實際樣本質量，也不會影響下游分析造成陽性結果。

開始前準備

1.DLB緩沖液加500µl試劑盒的水混勻，稍微離心溶解。

注意：重組的DLB緩沖液–20°C能放6個月。

Buffer DLB is pH-labile.

2.所有緩沖液和試劑使用前都要用漩渦混合器充分混勻。

3.水浴，heating block或熱循環儀溫度設為30°C。

如果熱循環儀帶加熱蓋，蓋子溫度設為70°C。

步驟¢

1.按表1配制足量（整個擴增流程所需）D2緩沖液（變性緩沖液）。

注意：表中提供的D2緩沖液用量足夠進行12次反應。沒用完的D2緩沖液–20°C 存放，但不要存放超過3個月。

表1.D2緩沖液配制

2. 4 µl樣本細胞（含PBS）加入微離心管。如果細胞不夠4 µl，加PBS sc補齊。

注意：REPLI-g單細胞擴增試劑盒提供的PBS sc量不夠用于樣本細胞的連續稀釋。

可以使用0.5 µl 全血。（Alternatively, 0.5 µl whole blood can be used.）

3.加入3 µl 配制的D2緩沖液。小心輕彈試管混勻，稍微離心。

注意：確保樣本細胞沒有貼在緩沖液線上的管壁。

4.65°C孵育10min。

1. 加入3 µl 終止液。小心輕彈試管混勻，稍微離心。冰上保存。

6.冰上解凍REPLI-g sc DNA聚合酶。其他成分室溫解凍，漩渦振蕩后稍微離心。

解凍后REPLI-g sc反應緩沖液可能會形成沉淀，漩渦振蕩10s可以溶解沉淀。

7.按表2配制master混合液。混勻，稍微離心。

要點：嚴格按照表2所列順序配制。加入水和反應緩沖液后，稍微漩渦振蕩和離心后再加入DNA聚合酶。

注意：一次性進行多次反應時，根據反應數量等比例增加用量。DNA聚合酶加好后maste混合液要立即投入使用。

表2：master混合液配制

多次反應，根據反應數量等比例增加劑量并增加10%。

8.每次反應，10 µl 變性DNA（步驟5）加入40 µl master 混合液。

9.30°C孵育8h。

30°C孵育后，水浴或其他加熱儀可以改設為65°C方便步驟10使用。

注意：如果使用帶加熱蓋的熱循環儀，蓋子溫度設為70°C。

10.DNA聚合酶65°C滅活3min。

11.如果不直接使用，擴增DNA 短期儲存在4°C，長期儲存在–20°C。

使用REPLI-g 單細胞擴增試劑盒擴增的DNA可以當作基因組DNA（zui低凍融循環），因此推薦zui低核酸儲存密度為100 ng/µl。

12.依照說明書用水或TE適量稀釋擴增DNA。用于PCR分析的擴增DNA按1:100稀釋，每次PCR反應使用2 µl 稀釋后DNA。

13.擴增DNA可用于一系列下游應用，包括：第二代測序，array CGH和定量PCR。

注意：每50 µl典型反應的DNA產量約40 µg，需要正確稀釋。擴增DNA定量見附件A。

方法二：純化基因組DNA擴增

略。詳情參見原版說明書。中文版翻譯可咨詢紅榮微再。

150343 REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒說明書節選由紅榮微再翻譯整理。

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很多研究人員使用二代測序儀器對生物樣本的DNA序列進行分析和基因分型，但經常受限于有限的樣本量。150343 REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒可均一的擴增單個細胞（1至1000個細菌或腫瘤細胞）或純化的基因組DNA，能夠覆蓋基因組所有位點。另有于干血或新鮮或冷凍的組織樣本的實驗方案。所有緩沖液和試劑生產都經過嚴格控制的流程，避免污染DNA，確保每次實驗獲得可靠的結果。該產品采用多重置換擴增（MDA）技術，對所有基因組位點進行無偏差的擴增。與基于PCR的全基因組擴增技術相比，該技術具有更好的擴增高保真度，避免出現假陽性或假陰性信號。

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